|
Abstract
|
HOTAIR (HOmeoboxTranscript Antisense Intergenic RNA) مخفف RNA آنتی سنس رونویسی هموباکس است. HOTAIR یک lincRNA(large intergenic noncoding RNA یعنی توالی DNA واقع در بین ژنهای با اینترونها متفاوت است که در واقع یکی از 5 زیر مجموعه RNAهای بلند غیر کد کننده (Long Noncoding RNA) است . HOTAIR نقش انکوژنی دارد و در تعدادی زیادی از سرطانها ازجمله پانکراس، کبد، معده، سروگردن، ریه و پستان شناسایی شده است HOTAIR ژنی با طول 2158 نوکلوتید واقع در لوکوس HoxC پستانداران است که یک منطقه روی کروموزوم 12، q13.13 است و دارای 6 اگزون است که نخستین بار به عنوان یک ژن سرکوبگر ژنهای منطقه HoxD شناخته شده است .منطقه HoxCbp 233 170 ژن غیر کد شونده و 68 تا اگزون دارد. HOTAIR دارای دو دومین '3 و '5 است که از طریق دومین '5 با کمپلکس پروتینی سرکوبگر POLYcombRepressiveComplex) PRC2 ) واز طریق دومین '3 خود به کمپلکس پروتیینی دیگری به نام LSD1/Co-REST/REST اتصال برقرار میکند و به ترتیب لیزین27 هیستون H3 را تری متیله میکند این پروتئینهای کمپلکس polycomb، واسطه سرکوب رونویسی هزاران ژن کنترل کننده مسیر تمایز سلولی در توسعه سلولها و بافتها هستند و در پرتوانی سلولهای بنیادی و سرطانی نقش اساسی دارند [7, 9] و از '3 خود لیزین4 هسیتون H3 را دی متیله کرده و با خاموشی حدود kb 40 از لوکوس HOXD روی کروموزوم 2 منطقه q3.1-q2.4 یک سرکوبگر تومور خاموش میشود که شامل ژنهایPCDH10 , PCDHB5 , HOXD10 , PGR است و منجربه آغاز سرطان میشود و به صورت اپی ژنتیک HOX D را تنظیم میکند. سرطان پستان نخستین گزارش از تنظیم خارج شدهیHOTAIR در سرطانها بود. نکته مهم این است که بیان بالای HOTAIR در سلولهای سرطانی اپیتلیال آغازگر تهاجم و متاستاز تومور میباشد و برعکس کاهش آن مانع تهاجم تومور میشود. در این پایان نامه تعداد بسیار زیادی از SNPهای موجود در ژن HOTAIR مورد بررسی قرار گرفت ودر نهایت یک SNP با نام rs920778 انتخاب گردید که در سال 2014 توسط پژوهشگران چینی شناسایی شد و در ناحیه اینترون 2 در فاصله 1719+تا 2353+ بازی از ناحیه اغاز رونویسی واقع شده است و نقش اینهسری دارد.
|