|
Title
|
تجزیه بیان ژن در برگ آفتابگردان تحت تنش شوری به روش توالی یابی RNA
|
|
Type of Research
|
Presentation
|
|
Keywords
|
آفتابگردان روغنی، ترنسکریپتوم، تنش شوری، توالی یابی RNA
|
|
Abstract
|
آفتابگردان یک سیستم مدل برای مطالعات ژنومی گیاهان خانواده Asteraceae می باشد. به دلیل داشتن ژرمپلاسم با تنوع گسترده برای عملکرد دانه، تعداد دانه، ارتفاع بوته، زودرسی و حساسیت به تنشهای زیستی و غیر زیستی، تجزیه و تحلیل ژنتیکی آفتابگردان میتواند بسیار مفید باشد. گردآوری مجدد توالیهای ترانسکریپتوم، راه حل مناسبی برای مطالعه ترانسکریپتوم موجوداتی است که توالی ژنوم آنها در دسترس نیست. در این مطالعه با تعیین توالی ترانسکریپتوم برگ آفتابگردان زراعی، با استفاده از نسل جدید توالی یابی تفاوت بیانی ژنها در گیاهان رشد یافته در شرایط نرمال و تیمار شده با شوری 8 دسی زیمنس بر متر مشخص شد. آنالیز تفاوت بیانی ژنها با استفاده نرم افزار CuffDiff نشان داد که 121 ژن بین نمونه تیمار شده و شاهد بهطور معنیداری متفاوت بیان شدهاند. به منظور بررسی ویژگیهای ساختاری و عملکردی ژنهای با بیان معنی- دار در دو گروه تیمار شده و شاهد، از نرمافزار Blast2Go و پایگاه اطلاعاتی BLASTX و NCBI و پایگاه اطلاعاتی KEGG استفاده شد. نتایج هستیشناسی، نشان داد از لحاظ عملکرد مولکولی، حدود 23 درصد از این ژنها در فرآیندهای اکسیداتیو دخیل هستند. بنابراین از طریق کاربرد تکنیک توالی یابی RNA توان بالقوه محققین در زمینه شناسایی مسیرهای بیوسننتزی ترکیبات ثانویه و نیز تعیین افزایش یا کاهش در میزان بیان ژنهای هدف، به منظور افزایش مقاومت به تنشها از طریق کاربرد تکنیکهای مهندسی ژنتیک افزایش خواهد یافت. پس از تایید عملکردهای زیستی ژنهای شناسایی شده با انجام آزمایشهای تکمیلی، از آنها میتوان در انواع دستورزیهای ژنتیکی استفاده نمود.
|
|
Researchers
|
Masoumeh Sharifi Alishah (First Researcher)، Reza Darvishzadeh (Second Researcher)، Mohammad Ahmadabadi (Third Researcher)، Yaser Piri Kashtiban (Fourth Researcher)، Karim Hasanpour (Fifth Researcher)
|