|
Title
|
تهیه نقشه ژنتیکی اشباع جمعیت لاین های اینبرد نوترکیب گندم نان
بهاره با استفاده از روش ارزیابی ژنوتیپی با توالی یابی (Genotyping by sequencing)
|
|
Type of Research
|
Article
|
|
Keywords
|
ارزیابی ژنوتیپی با توالییابی (GBS)
چندشکلی های تک نوکلئوتیدی
گندم
نقشه پیوستگی
|
|
Abstract
|
نقشه های ژنتیکی اشباع لازمه مکان یابی دقیق مکانهای ژنی کنترل کننده صفات کمی میباشند. در این مطالعه، نقشه ژنتیکی اشباع جمعیت لاین های اینبرد نوترکیب گندم نان بهاره حاصل از تلاقی رقم Yecora Rojo و ژنوتیپ بومی No. 49 با استفاده از روش ارزیابی ژنوتیپی با توالی یابی (GBS) تهیه شد. برای شناسایی چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (SNP)، توالی یابی والدین و لاینهای اینبرد نوترکیب به صورت تکرار دار در سه لاین دستگاه ایلومینا Illumina Hiseq 2500 انجام شد. در مجموع، بیش از 36 هزار SNP شناسایی شد که 804 SNP به هیچ گروه کروموزومی منتسب نشد. از این تعداد SNP، 3042 به زیر ژنوم A، 3977 به زیر ژنوم B و 769 SNP به زیر ژنوم D تعلق داشتند.پس از حذف SNP هایی با داده گمشده بیش از 20 درصد، فراوانی آلل نادر کمتر از 5 درصد و و نیز دارای انحراف تفرق از نسبت مندلی 1:1، تعداد 5831 نشانگر SNP شناسایی و به 21 کروموزوم گندم منتسب شدند. ان نشانگر ها، 14/3642 سانتی مورگان از ژنوم گندم را با متوسط فاصله 62/0 سانتی مورگان بین دو نشانگر مجاور پوشش دادند.
|
|
Researchers
|
Nayer Abdollahi sisi (First Researcher)، S. Abolgasem Mohammadi (Second Researcher)، Sara Ghaffarian (Third Researcher)
|