|
Title
|
آنالیز توان بالای ترانسکریپتوم در بیماری پسوریازیس بر مبنای داده های RNA-seq
|
|
Type of Research
|
Thesis
|
|
Keywords
|
پسوریازیس، RNA-seq، بیان ژن افتراقی، ژن انتولوژی، آنالیز مسیر
|
|
Abstract
|
پسوریازیس که در ایران با نام های صدف یا صدفک هم شناخته می شود یک بیماری مزمن و خود ایمن پوستی است که با خارش و التهاب پوست بدن بروز می یابد، ولی می تواند به بخش های دیگر بدن نیز آسیب برساند. در این بیماری سلول ها در سطح بدن چرخه ی زندگی سریع تری دارند و با سرعت زیاد تولید می شوند. به همین دلیل بافت ضخیم و نقره ای رنگی بوجود می آورند که باعث خارش، التهاب و قرمزی پوست می شود. این بیماری ممکن است دوره های مختلف عود و بهبود داشته باشد. هدف در درمان پسوریازیس توقف رشد سریع سلول ها است
پسوریازیس3-1 درصد جمعیت جهان را گرفتار می کند. این بیماری در سراسر جهان شایع است و انتشار آن بسته به نژاد و موقعیت جغرافیایی متفاوت است. بطوریکه در کشورهای اسکاندیناوی و شمال اروپا با شیوع نزدیک به 3 درصد بیشترین فراوانی را دارد اما شیوع آن در ژاپن تقریبا 2/0 درصد بوده و در هندی های آمریکا بسیار نادر است. از این جهت به نظر می رسد پسوریازیس یک بیماری مولتی فاکتوریال است که دو عامل ژنتیک و محیط در ایجاد آن موثرند. مردان و زنان به یک نسبت مبتلا می شوند گسترش ابزارهای آزمایشگاهی در حوزه ژنتیک مولکولی و نرم افزارهای وابسته جهت آنالیز داده های حاصل، سبب توسعه علم بیوانفورماتیک در شاخه های مختلف از جمله بیان ژن شده است. از آنجایی که در مطالعات بیان ژن، از محصول ژن به DNA می رسیم این تکنولوژی امکان طراحی الگوریتم یا مدلسازی براساس وقایع اتفاق افتاده طی بیان ژن را فراهم می کند
داده های بیان ژن اطلاعات ارزشمندی در مورد شبکه های بیولوژیک و عملکرد ژن ها ارائه می دهند. مقایسه پروفیل بیان ژن در سلول های سالم و بیمار و تحلیل چگونگی تاثیر بیان یک ژن منفرد بر بیان ژن های دیگر همان شبکه ی ژنی از اهداف تحلیل داده های بیان ژن است. پروفایل بیان ژن در مدیریت و کنترل بیماری های عفونی و مقایسه ی بیان ژن در سلول های دارای عملکرد سالم و معیوب کاربرد عملی دارد
امروزه تکنولوژی های توالی یابی با توان بالا بطور رایج در بیولوژی استفاده می شوند. این تکنولوژی ها مبتنی بر توالی یابی میلیون ها قطعه شکسته شده ی ژنوم یا ترانسکریپت هستند. RNA-Seqیکی از انواع این تکنیک ها است که مطالعات ترانسکریپتوم را براساس تکنولوژی های نسل جدید توالی یابی انجام می دهد. RNA-Seq بطور گسترده وابسته به ابزارهای بیوانفورماتیکی توسعه یافته جهت پشتی
|
|
Researchers
|
(Student)، Masoumeh Valipour (Primary Advisor)، Sara Ghaffarian (Primary Advisor)، nasser pouladi (Advisor)
|