|
Title
|
شناسایی برخی از گونه های Alternaria براساس توالی های nrDNA ITS و TEF
|
|
Type of Research
|
Presentation
|
|
Keywords
|
تاکسونومی، فیلوژنی، Alternaria ، ITS ، TEF
|
|
Abstract
|
شناسایی و رده بندی اعضا جنس Alternaria به علت تعداد زیاد گونه ها، واریته ها و فرمهای این جنس پیچیده می باشد و
همچنین تنوع مورفولوژیکی گستردهای بین جدایه های یک گونه نیز مشاهده میشود. امروزه با استفاده از نشانگرهای مولکولی،
روشهای شناسایی و تشخیص تنوع ژنتیکی ابعاد جدیدتری یافته است، بطوریکه شناسایی گونه ها در دهه های اخیر، با استفاده
از نشانگرهای مولکولی با اطمینان و سهولت بیشتری انجام میشود. در این پژوهش، جایگاه تاکسونومیکی پنج گونه از
Alternaria با استفاده از نشانگرهای ITS و TEF و ترسیم درخت فیلوژنتیک بر پایه NJ بررسی شد. در هر دو درخت
فیلوژنتیکی، گونه های A. alternantherae ، A. brassicicola و A. solani با درجه اعتبارسنجی 100 درصد در کلادهای
مجزا قرار گرفتند. ناحیه ITS اگرچه توانست جایگاه تاکسونومیکی دو گونه A. alternata و A. tenuissima را نشان دهد،
ولی قادر به تفکیک دو گونه مذکور از هم نبود. در مقابل، ناحیه TEF برای شناسایی و تفکیک دو گونه A. alternata و A. tenuissima مناسب به نظر میرسد. نتایج نشان داد در مقایسه با ITS ، درخت فیلوژنتیک ایجاد شده با استفاده از توالی TEF ،
از قابلیت مناسبتری برای شناسایی و تعیین جایگاه تاکسونومیکی گونه های مورد مطالعه برخوردار است.
|
|
Researchers
|
Mostafa Ebadi (First Researcher)
|