|
عنوان
|
مطالعه درون رایانه ای فاکتورهای رونویسی موثر بر تنظیم رونویسی ژن کلیدی
استیل کو آ کربوکسیلاز، دخیل در بیوسنتز متابولیت های ثانویه در Dunaliella salina
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه شده
|
|
کلیدواژهها
|
استیل کوآ، بیوانفورماتیک، - Dunaliella salina ، Acetyl-CoA carboxylase ، فاکتور رونویسی
|
|
چکیده
|
چکیده-
- Acetyl-CoA ( یکی از مولکول های مرکزی در متابولیسم سلولی و پیش ساز کلیدی در سنتز
متابولیت های ثانویه محسوب می شود. آنزیم استیل کوآ کربوکسیلاز ) ACC ( با تبدیل Acetyl-- Malonyl-CoA ،
نخستین گام در مسیر بیوسنتز اسیدهای چرب و سایر ترکیبات ثانویه را کنترل می کند و به عنوان نقطه تنظیمی مهم
در این مسیر شناخته می شود. با توجه به اهمیت تنظیم بیان ژن ACC در تولید ترکیبات زیستی ارزشمند، هدف این - -
پژوهش، شناسایی فاکتورهای رونویسی تنظیم این ژن در ریزجلبک - Dunaliella salina بود. به منظور دستیابی
به این هدف، ابتدا توالی ژن ACC و ناحیه پروموتر آن استخراج شد. سپس با استفاده از نرم افزار - MEME Suite -
موتیف های تنظیمی احتمالی در ناحیه پروموتر شناسایی گردید. این موتیف ها با پایگاه های داده JASPAR و
PlantTFDB مقایسه شدند تا فاکتورهای رونویسی احتمالی تعیین شوند. نتایج حاصل نشان داد که خانواده های
فاکتورهای رونویسی MYB و bZIP نقش مهمی در تنظیم ژن ACC دارند و احتمالاً در پاسخ به تنش های محیطی
مانند خشکی، دمای بالا، سرما و استرس اکسیداتیو دخیل هستند. این یافته ها، پایه ای برای راهبردهای مهندسی
متابولیک در جهت افزایش تولید متابولیت های ثانویه در D. salina فراهم می سازد و لزوم انجام مطالعات تجربی بیشتر
G A برای تأیید این نتایج را نشان می ده
|
|
پژوهشگران
|
فاطمه امیدی سانجود (نفر اول)، لیلا زرندی میاندواب (نفر دوم)
|