مشخصات پژوهش

عنوان	تجزیه و تحلیل درون رایانه ای عناصر تنظیمی ژن های مسیر بیوسنتز بتاکاروتن در Dunaliella salina
نوع پژوهش	پایان نامه
کلیدواژه‌ها	درون رایانه ای، تنظیم رونویسی ژن، بتاکاروتن،دونالیلا سالینا
چکیده	کاروتنوئیدها رنگدانه های جمع کننده نور هستند که به عنوان مولکول های آنتی اکسیدانی عمل می کنند. در بین کاروتنوئیدها، بتاکاروتن یک کاروتنوئید با ارزش بالا است که می تواند در بسیاری از حیوانات دریایی، گیاهان عالی و میکروارگانیسم ها از جمله میکروجلبک ها و قارچ ها تولید شود. با توجه به عملکرد قوی بتاکاروتن و فعالیت آنتی اکسیدانی قدرتمند آن و اثرات مفید گسترده بر سلامت انسان, بتاکاروتن از لحاظ پزشکی، داروسازی و اقتصادی اهمیت زیادی دارد. ریزجلبک سبز D. salina می تواند مقدار زیادی بتاکاروتن تولید نماید. محتوای بالای بتاکاروتن در D. salina آن را به یک کارخانه سلولی بزرگ برای تولید مقادیر زیاد بتاکاروتن تبدیل کرده است با این وجود، D. salina محدودیت های ذاتی مانند سرعت رشد آهسته و عملکرد زیست توده پایین دارد. همچنین مکانیسم تنظیمی تولید بتاکاروتن در D. salina هنوز واضح نیست که این امر مانعی برای تولید بتاکاروتن در مقیاس صنعتی می باشد. ابزار تنظیم مسیر بیوسنتز بتاکاروتن در D. salina آنزیم های این مسیر است و مقدار بتاکاروتن تولیدی به فعالیت و مقدار این آنزیم ها بستگی دارد. مقدار یا محتوای آنزیم تابعی از سرعت رونویسی و به دنبال آن ترجمه می باشد و فعالیت آنزیم تابعی از تغییرات پس از ترجمه و شرایط بهینه لازم برای فعالیت آنزیم است. مقدار این آنزیم ها نیز به میزان رونویسی بستگی دارد. تنظیم سرعت رونویسی به نحوه اتصال RNAپلیمراز به منطقه پروموتری ژن مرتبط بوده که این امر خود، نتیجه تجمع پروتئین های قابل اتصال بهDNA ناحیه cis در بالادست کدون شروع می باشد. فاکتورهای رونویسی پروتئین های متنوعی هستند که هر کدام طی مسیر ترارسانی علامت خاصی فعال شده و قادر به نشستن روی DNA پروموتر می شوند. عوامل محیطی با تحریک مسیرهای سیگنالینگ ویژه و از طریق TFها بر نحوه رونویسی از ژن ها تاثیر می گذارند. هدف ما از این بررسی این است که از نظر بیوانفورماتیکی رونویسی و ترجمه ژن های دخیل در بیوسنتز بتاکاروتن در تنش های محیطی را مورد بررسی قرار دهیم. همچنین میخواهیم اطلاعاتی را در زمینه ی فاکتورهای رونویسی و نحوه اتصال آنها به پروموتور که تحت تاثیر عوامل محیطی هستند، گردآوری کنیم.
پژوهشگران	پریسا ظرافت دوست (دانشجو)، لیلا زرندی میاندواب (استاد راهنما)، نادر چاپارزاده (استاد مشاور)