مشخصات پژوهش

عنوان	شناسایی پروتئین هایی با خاصیت الیسیتوری از باکتری Xanthomonas citri subsp. citri
نوع پژوهش	مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها	الیسیتور، زانتوموناس، پروتئین، اتیلن
چکیده	الگوهای مولکولی مرتبط با میکروب (MAMP) نقش کلیدی در فعال سازی ایمنی پایه در جانوران و گیاهان بازی می کنند. در مطالعات اولیه ما مشخص شد که عصاره پروتئینی Xanthomonas citri subsp. citri (عامل بیماری شانکر مرکبات) بر روی جفت موتانت گیاه آرابیدوپسیس fls2 x efr که نسبت به فلاژلین و EF-Tu (ممپ های معمول در باکتریها) پاسخ دهی ندارد، فعالیت ممپ قابل توجهی دارد. در این مطالعه تلاش شد تا عصاره پروتئینی فعال این باکتری خالص سازی و آنالیز شود. برای تعیین خاصیت الیسیتوری آموده های مختلف و در طول مراحل خالص سازی روش زیست سنجی تولید اتیلن مورد استفاده قرار گرفت. برای خالص سازی پروتئین های فعال عصاره پروتئینی از دستگاه FPLC مجهز شده به ستون Hitrap Q FF استفاده شد. فراکسیون ها فعال FPLC با استفاده از طیف سنجی جرمی متوالی آنالیز شدند تا پروتئین های آن شناسایی شود. آنالیز MS/MS توانست بیش از 60 پروتئین در فراکسیون فعال از FPLC شناسایی کند. عملکرد بسیاری از پروتئین های شناسایی شده از طریق آنالیز توالی آنها در ابزارها آنلاین بیوانفورماتیک مختلف تعیین شد. در بررسی های پیشین نقطه ایزوالکتریک و وزن مولکولی بخش فعال عصاره پروتئین زانتوموناس حدود 8 و 10 کیلودالتون تعیین شده بود. از بین پروتئین-های شناسایی شده تنها چهار پروتئین با ویژگیهای مشابه شناسایی شدند که شامل csrA (تنظیم گر ذخیره کربن)، cspA (پروتئین شوک سرمایی) و یک پروتئین محافظت شده بودند.
پژوهشگران	وحید فلاح زاده ممقانی (نفر اول)