مشخصات پژوهش

عنوان	شناسایی برخی از گونه های Alternaria براساس توالی های nrDNA ITS و TEF
نوع پژوهش	مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها	تاکسونومی، فیلوژنی، Alternaria ، ITS ، TEF
چکیده	شناسایی و رده بندی اعضا جنس Alternaria به علت تعداد زیاد گونه ها، واریته ها و فرمهای این جنس پیچیده می باشد و همچنین تنوع مورفولوژیکی گستردهای بین جدایه های یک گونه نیز مشاهده میشود. امروزه با استفاده از نشانگرهای مولکولی، روشهای شناسایی و تشخیص تنوع ژنتیکی ابعاد جدیدتری یافته است، بطوریکه شناسایی گونه ها در دهه های اخیر، با استفاده از نشانگرهای مولکولی با اطمینان و سهولت بیشتری انجام میشود. در این پژوهش، جایگاه تاکسونومیکی پنج گونه از Alternaria با استفاده از نشانگرهای ITS و TEF و ترسیم درخت فیلوژنتیک بر پایه NJ بررسی شد. در هر دو درخت فیلوژنتیکی، گونه های A. alternantherae ، A. brassicicola و A. solani با درجه اعتبارسنجی 100 درصد در کلادهای مجزا قرار گرفتند. ناحیه ITS اگرچه توانست جایگاه تاکسونومیکی دو گونه A. alternata و A. tenuissima را نشان دهد، ولی قادر به تفکیک دو گونه مذکور از هم نبود. در مقابل، ناحیه TEF برای شناسایی و تفکیک دو گونه A. alternata و A. tenuissima مناسب به نظر میرسد. نتایج نشان داد در مقایسه با ITS ، درخت فیلوژنتیک ایجاد شده با استفاده از توالی TEF ، از قابلیت مناسبتری برای شناسایی و تعیین جایگاه تاکسونومیکی گونه های مورد مطالعه برخوردار است.
پژوهشگران	مصطفی عبادی نهاری (نفر اول)