|
عنوان
|
بررسی بیان ژن TYDC2 در بافت های ریشه، برگ، ساقه و ارتباط آن با میزان کالوس زایی این بافت ها در گیاه دارویی خشخاش(Papaver somniferum L.)
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله چاپ شده
|
|
کلیدواژه‌ها
|
بیان ژن،توالی یابی، کالوس زایی، هورمون اکسین
|
|
چکیده
|
خشخاش با نام علمی Papaver somniferum L. متعلق به خانواده Papaveraceae است. بیش از 40 نوع آلکالوئید، در خشخاش شناخته شده است که مهمترین آنها مورفین، کدئین، تبائین، نوسکاپین و پاپاورین می باشد. هدف از این پژوهش؛ شناسایی میزان بیان ژن TYDC2 در سه بافت ساقه، ریشه و برگ گیاه دارویی خشخاش از طریق NGS بوده و ارتباط آن را با میزان کالوس زایی این بافت ها ارزیابی می کند. بررسی بیان ژن TYDC2 می تواند به درک بهتر مکانیسم های بیولوژیکی که در فرآیند کالوس زایی و توسعه بافت های مختلف گیاه دخیل هستند و همینطور به بهبود روش های کشت بافت و تولید گیاهان دارویی کمک کند. در این تحقیق، توالی این ژن در سه بافت ساقه، ریشه و برگ گیاه خشخاش، از بخش Gene سایت NCBI انتخاب شد و توسط ابزار SRAtoolkit دانلود گردید و کیفیت آن ها توسط ابزار fastqc مورد ارزیابی قرار گرفت و نمودار heatmap با نرم افزار Rstudio و سایر نمودارهای مقایسه بیان ژن، ترسیم گردید. در ادامه، محیط کشت موراشیک-اسکوگ با هورمون 2,4-D با غلظت 2 میلی گرم بر لیتر تهیه شد و بافت های ذکر شده در این محیط قرار گرفت و درصد کالوسزایی، قطر و وزن کالوس بررسی شد و با میزان بیان ژن مقایسه گردید. در انتها، این ژن با ژن آنتولوژی توسط gprofiler مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج این بررسی نشان داد؛ میزان بیان ژن تولیدی در بافت های ساقه، ریشه و برگ گیاه دارویی خشخاش، متفاوت بوده و میزان بیان در بافت برگ بیشتر از سایر بافت های مورد آزمایش می باشد. کمترین میزان بیان نیز در بافت ریشه مشاهده گردید و همینطورنتایج کالوسزایی این سه بافت گیاهی با هورمون 2,4-D (2 میلی گرم بر لیتر) در شرایط درون شیشه ای نشان داد، که میزان کالوسزایی در بافت برگ بیشتر از سایر بافت ها بوده و کمترین میزان کالوسزایی نیز در بافت ریشه مشخص گردید، که نشان دهنده ی ارتباط مستقیم بین بیان ژن و میزان کالوسزایی در بافت ها است. این تحقیق می تواند به گسترش دانش علمی در زمینه ژنتیک و بیوتکنولوژی گیاهی کمک کرده و به عنوان مرجع برای تحقیقات آینده در این حوزه عمل نماید.
|
|
پژوهشگران
|
نازیلا باقری (نفر اول)، علیرضا تاری نژاد (نفر دوم)، محمد مجیدی (نفر سوم)، کریم حسنپور (نفر چهارم)
|